Syno®小鼠CRISPR文库(Human Genome CRISPR Libraries)
CRISPR技术作为继ZFN和TALEN之后第三代基因编辑技术，具有高效、快速、精准等特点，广泛应用于基因功能研究、药物开发、作物育种、分子诊断、精准医疗等领域。利用CRISPR 文库进行基因组功能筛选一直是当下热门的研究手段，被全球知名期刊争相报道。
CRISPR文库虽然是进行科学研究的强大工具，但是由于其后期筛选工作量大、成本消耗高，也成为了其普遍应用的阻碍。泓迅科技专注于CRISPR基因编辑技术的研究工作，不断提升服务和产品的供应能力，在定制化CRISPR文库构建的基础上，推出Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库，领先的设计和规范化的文库构建实现高质量交付，降低客户的研究成本，缩短产品交付周期。
Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库根据Genome CRISPR数据库中记录的以前发表的CRISPR筛选中的表型以高靶向活性和低脱靶效率为准则，结合多种不同的设计原则，选择评分较高的sgRNA序列。根据近期发表的评分规则，Syno®CRISPR文库的评分要优于GeCKOv2文库和随机挑选的已发表sgRNA样本。
Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库由三个独立子库A、B、C组成，A和B文库分别针对18,913和18,334个蛋白质编码基因。子库A包含根据设计标准排名最好的sgRNA，在较低的文库覆盖率下实现高质量的筛选。子库B包含第二层sgRNA，当需要更高的sgRNA覆盖率时，可以用来补充子库A。子库C是通过整合大规模CRISPR筛选的标准化资源，以及多个效率指标，对广泛采用的CRISPR文库中的300,000多个特有的sgRNA进行评估和排序，设计出了一个优化的人类最小全基因组敲除文库，针对18,761个基因，每个基因设计2个优化的sgRNA，合计有37,522个基因靶向和200个非靶向sgRNA。子库C的大小比目前公开的人类全基因组CRISPR文库均小。虽然子库C较小但是并不影响对必须基因的识别，多用于复杂条件下癌症细胞模型的CRISPR筛选。
文库产品优势
- 精准的sgRNA设计：利用有效的sgRNA设计模型结合深度学习算法，设计出具有高靶向活性和低脱靶率的sgRNA序列。
- 优化的载体：采用lentiCRISPRv2载体，具备Puro药筛功能，可进行慢病毒包装，提高转染效率。
- 节约成本：高编辑效率CRISPR文库，减轻后期筛选工作的难度，降低研究成本。
- 一站式服务：提供NGS验证、病毒包装、生信分析等定制化的服务。
- 严格质控：构建的文库覆盖率>99.9%，均一性<10。
- 交付周期短：质粒文库次日发货。
文库产品详情
Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库
| 产品编号 | 产品名称 | 序列信息 | 载体信息 | 价格（元） | 规格 |
|---|---|---|---|---|---|
| STCRI211101 | Syno®人类全基因组 CRISPR敲除文库 (Human Genome CRISPR Knockout Libraries) |
子库A： 靶向18,913个基因，设计74,552个sgRNA序列和435个对照（非靶向）sgRNA序列，合计74,987个sgRNA序列。 |
pLentiCRISPR v2-Puro （单质粒系统）  pLentiGuide-Puro(双质粒系统) pLentiGuide-Puro-GFP(双质粒系统) |
咨询 | 200μg |
| STCRI211102 | 子库B： 靶向18,334个基因，设计71,048个sgRNA序列和435个对照（非靶向）sgRNA序列，合计71,483个sgRNA序列。 |
pLentiCRISPR v2-Puro （单质粒系统） pLentiGuide-Puro(双质粒系统) pLentiGuide-Puro-GFP(双质粒系统) |
咨询 | 200μg | |
| STCRI211103 | 子库C： 靶向18,761个基因，设计37,522个sgRNA序列和200个对照（非靶向）sgRNA序列，合计37,722个sgRNA序列。 |
pLentiCRISPR v2-Puro （单质粒系统） pLentiGuide-Puro(双质粒系统) pLentiGuide-Puro-GFP(双质粒系统) |
咨询 | 200μg | |
| STCRI233301 | Syno®人类全基因组 CRISPR激活文库 (Human Genome CRISPR Activation Library) |
子库A： 靶向18,885个基因，设计56,266个sgRNA序列和496个对照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。 |
Syn-pXPR_502 （双质粒系统） |
咨询 | 200μg |
| STCRI233302 | 子库B： 靶向18,843个基因，设计55,980个sgRNA序列和496个对照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。 |
Syn-pXPR_502 （双质粒系统） |
咨询 | 200μg | |
| STCRI113345 | Syno®人类膜蛋白 CRISPR激活文库 (Human Membrane Protein CRISPR Activation Library) |
靶向6,213个基因的启动子，设计58,570个sgRNA序列。 | pKVL2-U6gRNA_ SAM(BbsI)-PGKpuroBFP-W |
咨询 | 200μg |
| STCRI100052 | Syno®小鼠全基因组 CRISPR敲除文库 (Mouse Genome CRISPR Knockout Library) |
靶向20,611个基因和1,175个miRNA 3个sgRNA/基因。 |
pLentiCRISPR v2-Puro （单质粒系统） |
咨询 | 200μg |
| STCRI240053 | Syno®小鼠细胞表面蛋白 CRISPR敲除文库 (Mouse Membrane Protein CRISPR Knockout Library) |
靶向1,157个基因，对照基因(49个必须基因，49个非必须基因)，sgRNA数4,993。 | LentiCRISPR v2 | 咨询 | 200μg |
| STCRI240054 | Syno®小鼠代谢 CRISPR敲除文库 (Mouse Metabolism CRISPR Knockout Library) |
靶向2,918个基因，sgRNA数18,342，对照基因数目1000。 | LentiCRISPR v2 | 咨询 | 200μg |
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相关服务
sgRNA定制化设计
sgRNA文库构建
ssDNA合成
微生物基因组编辑
哺乳动物基因组编辑
sgRNA生物信息分析
参考资料
[1] Luisa Henkel, Benedikt Rauscher, Barbara Schmitt, et al. Genome-scale CRISPR screening at high sensitivity with an empirically designed sgRNA library. BMC Biol. 2020; 18: 174.
[2]Emanuel Gonçalves, Mark Thomas, Fiona M. Behan, et al. Minimal genome-wide human CRISPR-Cas9 library. Genome Biol. 2021; 22: 40.
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