Syno®人类全基因组CRISPR文库(Human Genome CRISPR Libraries)
CRISPR技术作为继ZFN和TALEN之后第三代基因编辑技术，具有高效、快速、精准等特点，广泛应用于基因功能研究、药物开发、作物育种、分子诊断、精准医疗等领域。利用CRISPR 文库进行基因组功能筛选一直是当下热门的研究手段，被全球知名期刊争相报道。
CRISPR文库虽然是进行科学研究的强大工具，但是由于其后期筛选工作量大、成本消耗高，也成为了其普遍应用的阻碍。泓迅科技专注于CRISPR基因编辑技术的研究工作，不断提升服务和产品的供应能力，在定制化CRISPR文库构建的基础上，推出Syno®人类全基因组CRISPR文库，领先的设计和规范化的文库构建实现高质量交付，降低客户的研究成本，缩短产品交付周期。
文库产品优势
- 精准的sgRNA设计：利用有效的sgRNA设计模型结合深度学习算法，设计出具有高靶向活性和低脱靶率的sgRNA序列。
- 优化的载体：具备Puro药筛功能，可进行慢病毒包装，提高转染效率。
- 节约成本：高编辑效率CRISPR文库，减轻后期筛选工作的难度，降低研究成本。
- 一站式服务：提供NGS验证、病毒包装、生信分析等定制化的服务。
- 严格质控：构建的文库覆盖率>99.9%，均一性<10。
- 交付周期短：质粒文库次日发货。
文库产品详情
Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库
Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库根据Genome CRISPR数据库中记录的以前发表的CRISPR筛选中的表型以高靶向活性和低脱靶效率为准则，结合多种不同的设计原则，选择评分较高的sgRNA序列。根据近期发表的评分规则，Syno®CRISPR文库的评分要优于GeCKOv2文库和随机挑选的已发表sgRNA样本。
Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库由三个独立子库A、B、C组成，A和B文库分别针对18,913和18,334个蛋白质编码基因。子库A包含根据设计标准排名最好的sgRNA，在较低的文库覆盖率下实现高质量的筛选。子库B包含第二层sgRNA，当需要更高的sgRNA覆盖率时，可以用来补充子库A。子库C是通过整合大规模CRISPR筛选的标准化资源，以及多个效率指标，对广泛采用的CRISPR文库中的300,000多个特有的sgRNA进行评估和排序，设计出了一个优化的人类最小全基因组敲除文库，针对18,761个基因，每个基因设计2个优化的sgRNA，合计有37,522个基因靶向和200个非靶向sgRNA。子库C的大小比目前公开的人类全基因组CRISPR文库均小。虽然子库C较小但是并不影响对必须基因的识别，多用于复杂条件下癌症细胞模型的CRISPR筛选。
| 产品编号 | 产品名称 | 序列信息 | 载体信息 | 价格（元） | 规格 |
|---|---|---|---|---|---|
| STCRI211101 | Syno®人类全基因组 CRISPR敲除文库 (Human Genome CRISPR Knockout Libraries) |
子库A： 靶向18,913个基因，设计74,552个sgRNA序列和435个对照（非靶向）sgRNA序列，合计74,987个sgRNA序列。 |
pLentiCRISPR v2-Puro （单质粒系统）  pLentiGuide-Puro(双质粒系统) pLentiGuide-Puro-GFP(双质粒系统) |
咨询 | 200μg |
| STCRI211102 | 子库B： 靶向18,334个基因，设计71,048个sgRNA序列和435个对照（非靶向）sgRNA序列，合计71,483个sgRNA序列。 |
pLentiCRISPR v2-Puro （单质粒系统） pLentiGuide-Puro(双质粒系统) pLentiGuide-Puro-GFP(双质粒系统) |
咨询 | 200μg | |
| STCRI211103 | 子库C： 靶向18,761个基因，设计37,522个sgRNA序列和200个对照（非靶向）sgRNA序列，合计37,722个sgRNA序列。 |
pLentiCRISPR v2-Puro （单质粒系统） pLentiGuide-Puro(双质粒系统) pLentiGuide-Puro-GFP(双质粒系统) |
咨询 | 200μg |
*更多服务信息，请咨询support@synbio-tech.com。
Syno®人类全基因组敲除阴性对照库可作为人全基因组CRISPR sgRNA文库的阴性对照，适用于人类细胞下的实验。
Syno®人类全基因组敲除阴性对照库
产品编号
产品名称
序列信息
载体信息
价格（元）
规格
STCRI24301
Syno®人类全基因组
敲除阴性对照库
(Human Genome Knockout Negative Control Library)20个对照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。
pLentiCRISPR v2-Puro
（单质粒系统）咨询
150μg
STCRI24302
50个对照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。
pLentiCRISPR v2-Puro
（单质粒系统）咨询
150μg
STCRI24303
100个对照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。
pLentiCRISPR v2-Puro
（单质粒系统）咨询
150μg
STCRI24304
200个对照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。
pLentiCRISPR v2-Puro
（单质粒系统）咨询
150μg
STCRI24305
500个对照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。
pLentiCRISPR v2-Puro
（单质粒系统）咨询
150μg
STCRI24306
1000个对照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。
pLentiCRISPR v2-Puro
（单质粒系统）咨询
150μg
STCRI24307
2000个对照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。
pLentiCRISPR v2-Puro
（单质粒系统）咨询
150μg
*更多服务信息，请咨询support@synbio-tech.com。
Syno®人类全基因组CRISPR激活文库
产品编号
产品名称
序列信息
载体信息
价格（元）
规格
STCRI233301
Syno®人类全基因组
CRISPR激活文库
(Human Genome CRISPR Activation Library)子库A：
靶向18,885个基因，设计56,266个sgRNA序列和496个对照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。
Syn-pXPR_502
（双质粒系统）咨询
200μg
STCRI233302
子库B：
靶向18,843个基因，设计55,980个sgRNA序列和496个对照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。
Syn-pXPR_502
（双质粒系统）咨询
200μg
*更多服务信息，请咨询support@synbio-tech.com。
Syno®人类膜蛋白CRISPR激活文库
产品编号
产品名称
序列信息
载体信息
价格（元）
规格
STCRI113345
Syno®人类膜蛋白
CRISPR激活文库
(Human Membrane Protein CRISPR Activation Library)
靶向6,213个基因的启动子，设计58,071个sgRNA序列和500个对照（非靶向）sgRNA序列，合计58,571个sgRNA序列。
pKVL2-U6gRNA_
SAM(BbsI)-PGKpuroBFP-W咨询
200μg
Human Pathway sgRNA文库
CRISPR文库是基于CRISPR/Cas9技术建立的高通量基因筛选方案，研究基因在代谢通路或某些特定疾病发生过程中的功能，确认与表型相关的基因或筛选药物新靶点。
泓迅科技专注于CRISPR基因编辑技术的研究与开发，在CRISPR定制化文库构建服务的基础上，为持续提升产品和服务供应能力，从基因、细胞、免疫系统等不同研究层面推出100多种Human pathway sgRNA文库，为特定通路的靶向筛选等相关研究提供高效工具。
产品优势
- 100+ Human pathway sgRNA文库供客户选择
- 文库的靶点基因是通过KEGG与较新的NCBI RefSeq人基因组数据交叉、并与科学研究前沿相结合下的选择
- 泓迅科技SynoGPS平台下的独家算法设计，每个靶点包含4条低脱靶效率的sgRNA序列
- 200+定制化文库交付经验，保证产品质量
- 相关客户陆续发表文献26篇，最高影响因子达36.558
人源Pathway sgRNA文库信息表如下：
| 代谢过程 | 文库编号 | 通路名称 | 载体 | 基因数目 |
|---|---|---|---|---|
| 常见通路（现货） | SHPF231311 | ABC transporter pathway | Lentisyn001 | 100 |
| SHPF231312 | Acute myeloid leukemia pathway | 45 | ||
| SHPF231313 | Adipogenesis pathway | 126 | ||
| SHPF231314 | Adult stem cell pathway | 58 | ||
| SHPF231315 | Angiogenesis pathway | 92 | ||
| SHPF231316 | Apoptosis pathway | 68 | ||
| SHPF231317 | cAMP&Ca pathway | 91 | ||
| SHPF231318 | Cell cycle pathway | 84 | ||
| SHPF231319 | Chemokine pathway | 134 | ||
| SHPF231320 | Drug Resistance pathway | 348 | ||
| SHPF231321 | ES differentiation pathway | 334 | ||
| SHPF231322 | GPCR pathway | 280 | ||
| SHPF231323 | Hormone activity pathway | 108 | ||
| SHPF231324 | Ion channel pathway | 67 | ||
| SHPF231325 | P450 pathway | 57 | ||
| SHPF231326 | Tumor metastasis pathway | 60 | ||
| SHPF231327 | Tumor suppressor pathway | 720 | ||
| SHPF231328 | Neelamegham human glycogene pathway | 347 | ||
| SHPF231329 | Human mTORC1 pathway | 713 | ||
| SHPF231330 | Pan druggable library | 75 | ||
| DNA复制与修复 | SHPF231001 | Base excision repair | 33 | |
| SHPF231002 | DNA replication | 36 | ||
| SHPF231003 | Fanconi anemia pathway | 54 | ||
| SHPF231004 | Homologous recombination | 41 | ||
| SHPF231005 | Mismatch repair | 23 | ||
| SHPF231006 | Non-homologous end-joining | 13 | ||
| SHPF231007 | Nucleotide excision repair | 47 | ||
| 转录 | SHPF232001 | Basal transcription factors | 45 | |
| SHPF232002 | RNA polymerase | 34 | ||
| SHPF232003 | Spliceosome | 154 | ||
| 翻译 | SHPF233001 | Aminoacyl-tRNA biosynthesis | 66 | |
| SHPF233002 | mRNA surveillance pathway | 97 | ||
| SHPF233003 | Nucleocytoplasmic pathway | 108 | ||
| SHPF233004 | Ribosome biogenesis in eukaryotes | 118 | ||
| SHPF233005 | Ribosome | 167 | ||
| 运输与分解代谢 | SHPF234001 | Autophagy | 141 | |
| SHPF234002 | Endocytosis | 251 | ||
| SHPF234003 | Lysosome | 132 | ||
| SHPF234004 | Mitophagy | 72 | ||
| SHPF234005 | Peroxisome | 82 | ||
| SHPF234006 | Phagosome | 152 | ||
| 细胞群落 | SHPF235001 | Adherens junction | 71 | |
| SHPF235002 | Focal adhesion | 201 | ||
| SHPF235003 | Gap junction | 88 | ||
| SHPF235004 | Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells | 143 | ||
| SHPF235005 | Tight junction | 169 | ||
| 细胞死亡 | SHPF236001 | Apoptosis | 136 | |
| SHPF236002 | Cell cycle | 127 | ||
| SHPF236003 | Cellular senescence | 156 | ||
| SHPF236004 | Ferroptosis | 41 | ||
| SHPF236005 | Necroptosis | 159 | ||
| SHPF236006 | Oocyte meiosis | 131 | ||
| SHPF236007 | p53 signaling pathway | 73 | ||
| 细胞运动 | SHPF236101 | Regulation of actin cytoskeleton | 229 | |
| 折叠，分选及降解 | SHPF237001 | Proteasome | 46 | |
| SHPF237002 | Protein export | 23 | ||
| SHPF237003 | Protein processing in endoplasmic reticulum | 171 | ||
| SHPF237004 | RNA degradation | 79 | ||
| SHPF237005 | SNARE interactions in vesicular transport | 33 | ||
| SHPF237006 | Sulfur relay system | 8 | ||
| SHPF237007 | Ubiquitin mediated proteolysis | 142 | ||
| 生长与再生 | SHPF238001 | Axon guidance | 182 | |
| SHPF238002 | Osteoclast differentiation | 128 | ||
| 信号转导 | SHPF239001 | AMPK signaling pathway | 121 | |
| SHPF239002 | Apelin signaling pathway | 139 | ||
| SHPF239003 | Calcium signaling pathway | 240 | ||
| SHPF239004 | cAMP signaling pathway | 225 | ||
| SHPF239005 | cGMP-PKG signaling pathway | 167 | ||
| SHPF239006 | ErbB signaling pathway | 85 | ||
| SHPF239007 | FoxO signaling pathway | 131 | ||
| SHPF239008 | Hedgehog signaling pathway | 56 | ||
| SHPF239009 | HIF-1 signaling pathway | 109 | ||
| SHPF239010 | Hippo signaling pathway | 157 | ||
| SHPF239011 | JAK-STAT signaling pathway | 166 | ||
| SHPF239012 | MAPK signaling pathway | 294 | ||
| SHPF239013 | mTOR signaling pathway | 156 | ||
| SHPF239014 | NF-kappa B signaling pathway | 104 | ||
| SHPF239015 | Notch signaling pathway | 59 | ||
| SHPF239016 | Phosphatidylinositol signaling system | 97 | ||
| SHPF239017 | Phospholipase D signaling pathway | 148 | ||
| SHPF239018 | PI3K-Akt signaling pathway | 354 | ||
| SHPF239019 | Rap1 signaling pathway | 210 | ||
| SHPF239020 | Ras signaling pathway | 236 | ||
| SHPF239021 | Sphingolipid signaling pathway | 119 | ||
| SHPF239022 | TGF-beta signaling pathway | 95 | ||
| SHPF239023 | TNF signaling pathway | 114 | ||
| SHPF239024 | VEGF signaling pathway | 59 | ||
| SHPF239025 | Wnt signaling pathway | 170 | ||
| 信号分子与互作 | SHPF231011 | Cell adhesion molecules | 157 | |
| SHPF231012 | Cytokine-cytokine receptor interaction | 295 | ||
| SHPF231013 | ECM-receptor interaction | 88 | ||
| SHPF231014 | Neuroactive ligand-receptor interaction | 367 | ||
| SHPF231015 | Viral protein interaction with cytokine and cytokine receptor | 100 | ||
| 循环系统 | SHPF231111 | Adrenergic signaling in cardiomyocytes | 154 | |
| SHPF231112 | Cardiac muscle contraction | 87 | ||
| SHPF231113 | Vascular smooth muscle contraction | 134 | ||
| 免疫系统 | SHPF231211 | Antigen processing and presentation | 78 | |
| SHPF231212 | B cell receptor signaling pathway | 82 | ||
| SHPF231213 | Chenokine signaling pathway | 192 | ||
| SHPF231214 | Complement and coagulation cascades | 86 | ||
| SHPF231215 | C-type lectin receptor signaling pathway | 104 | ||
| SHPF231216 | Cytosolic DNA-sensing pathway | 66 | ||
| SHPF231217 | Fc epsilon RI signaling pathway | 68 | ||
| SHPF231218 | Fc ganna R-mediated phagocytosis | 97 | ||
| SHPF231219 | Hematopoietic cell lineage | 99 | ||
| SHPF231220 | IL-17 signaling pathway | 94 | ||
| SHPF231221 | Intestinal immune network for IgA production | 49 | ||
| SHPF231222 | Leukocyte transendothelial migration | 114 | ||
| SHPF231223 | Natural killer cell mediated cytotoxicity | 132 | ||
| SHPF231224 | Neutrophil extracellular trap formation | 190 | ||
| SHPF231225 | NOD-like receptor signaling pathway | 186 | ||
| SHPF231226 | Platelet activation | 124 | ||
| SHPF231227 | RIG-I-like receptor signaling pathway | 71 | ||
| SHPF231228 | T cell receptor signaling pathway | 104 | ||
| SHPF231229 | Th1 and Th2 cell differntiation | 92 | ||
| SHPF231230 | Th17 cell differentiation | 108 | ||
| SHPF231231 | Toll-like receptor signaling pathway | 104 |
Pathway sgRNA质粒文库交付内容
- • 200µg液态质粒
- • CoA文件
- • 阵列板式液态质粒
- • 基因阵列排布信息
- • CoA文件
参考资料
[1] Luisa Henkel, Benedikt Rauscher, Barbara Schmitt, et al. Genome-scale CRISPR screening at high sensitivity with an empirically designed sgRNA library. BMC Biol. 2020; 18: 174.
[2]Emanuel Gonçalves, Mark Thomas, Fiona M. Behan, et al. Minimal genome-wide human CRISPR-Cas9 library. Genome Biol. 2021; 22: 40.
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