B细胞抗体测序分析服务

B细胞，即B淋巴细胞，主要执行机体的体液免疫，在抗原刺激下分泌产生抗体并发挥作用。在适应性免疫应答期间，活化的B细胞扩增并经历其B细胞受体（BCR）的体细胞超突变，形成多样化的细胞克隆。此外，抗体作为复合物分子，其每个重链（VH）和轻链（VL）中存在三个互补决定区（CDR），并且重链的CDR3变化最为丰富，可在V，D和J基因区段之间的连接处形成并且倾向于高水平的超突变。因此，B细胞产生的天然VH / VL抗体对理解抗体生物学和设计至关重要。

服务优势

专有的抗体大数据平台，可对抗体的重链和轻链配对进行打分，筛选最可能的完整抗体序列

独特的内部数据挖掘工具，对抗体测序结果进行预处理，降低假阳性等测序误差

完备的生物信息学分析，经验丰富的抗体研究团队，深度挖掘高价值信息

服务流程

泓迅经典案例

泓迅科技根据客户所提供的抗体测序原始数据，通过生物信息学分析，对细胞VDJ重构、V/J基因频率、V-J成对使用频率、CDR3长度分析、B细胞克隆计数、受体多样性分析、组间多样性差异分析、组间V、J基因差异分析、组间克隆表达CDR3长度分布差异等详细分析，并提供了专业的研究报告。

结果展示：
1） VDJ 基因使用频率分析

Table BCR样本中 V 基因使用频率统计

Gene_name	Reads	Frequency
4-39*01	27980	4.97
4-34*01	12488	2.22
1-2*02	5007	0.889
3-74*01	4798	0.852
1-18*01	3011	0.535
3-7*01	2862	0.508
2-70*13	2313	0.411
3-74*03	2240	0.398
1-69*01	1943	0.345
4-31*03	1583	0.281
…	…	…

2） CDR3 区域长度分析

3） CDR3种类分析

BCR测序统计CDR3氨基酸序列长度

CDR3	Reads	Frequency	len
DNNNDMR	3560	0.004869	7
VISRTL	1688	0.002308	6
AVDSNYQLI	899	0.001229	9
AVNRDDKII	718	0.000982	9
AATDSWGKLQ	696	0.000952	10
AVTDSWGKLQ	627	0.000857	10
AVNTGNQFY	595	0.000814	9
AVTGGGNKLT	573	0.000784	10
AVPTGTASKLT	562	0.000769	11
LVGDTGRRALT	540	0.000738	11
AEITLT	517	0.000707	6

4） 序列总长排序

BCR氨基酸序列总长reads数

氨基酸基因序列长度	氨基酸数目	丰度
1491	147	0.096324
20	139	0.044324
540	143	0.040395
529	145	0.041238
516	147	0.041955
504	143	0.042773
496	141	0.043976
441	145	0.040898
433	145	0.041868
387	148	0.039055

5） 不同样本之间的VH基因的频率差异分析

6） 样本测序饱和度分析

7） 克隆多样性分析

上机类型	Shannon Entropy	Inverse Simpson
BCR	19.7458	340.758

服务详情

服务名称	主要内容	分析软件	交付周期	交付项目
B细胞抗体测序分析服务	测序数据挖掘； 抗体信息分析等	R, Python Software等	7~10天	分析报告

* 如需订购抗体测序服务，请了解相关服务：杂交瘤细胞抗体基因测序、抗体组库/免疫组库测序，或详询support@synbio-tech.com。

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