Oligo Pool1
泓迅科技的Syno® 3.0合成平台利用电化学技术,可在一张芯片上同时合成上万条引物。合成后将引物从芯片上洗脱下来,即可得到含有上万条引物的混合溶液,即引物池(Oligo Pool)。可广泛应用于sgRNA文库、FISH探针、液相捕获探针和基因组合成。

服务优势

Oligo Pool

Oligo Pool服务周期

引物长度/nt <10,000条 10,000-23,232条 23,233-46,465条 46,465-92,928条 >92,929条
<120 3-4周 3-4周 3-4周 3-4周 3-4周
120-150 3-4周 3-4周 3-4周 3-4周 3-4周
150-200 4-5周 4-5周 4-5周 4-5周 咨询

 

应用方向

1.sgRNA文库
sgRNA文库以其操作简单和物种通用性强的独特优势,成为开展基因组大规模筛选的有力工具。通过sgRNA文库可以快速、高效的实现基因组/代谢通路范围内的基因功能缺失,从而筛选到相关功能基因。目前,sgRNA文库在基因功能分析、药物靶点筛选和精准医疗等领域有广泛的应用。泓迅科技专利的Syno® 3.0 合成技术平台,可以快速高效地实现sgRNA文库合成与构建,结合高通量/高内涵筛选平台,利用控制细胞存活、结合免疫染色、流式细胞术等手段筛选得到所需细胞,最终通过测序等方法推断出发挥作用的靶基因。
以人类肿瘤研究为例,如针对与人类肿瘤相关的4,000个基因设计sgRNA,每个基因设计3条sgRNA,共需要合成12,000条sgRNA,芯片Oligo Pool方法更加简便、快捷,可以大幅度缩短实验周期,降低成本。

合成平台 突变率 周期
普通引物合成方法 Syno® 1.0 低至1‰ 6-8周
Oligo Pool方法 Syno® 3.0 2-5‰ 3-4周

2. FISH探针
FISH探针可与靶DNA序列同源互补形成杂交体,具有快速、稳定、灵敏度高等特点,是目前染色体DNA序列研究的重要工具,广泛应用于基因组结构研究方向、精准医疗、细胞遗传学、肿瘤检测及防治等。
Syno® Vision FISH探针合成平台利用Syno® 3.0芯片合成平台设计及生产寡核苷酸荧光原位杂交探针,可将染色体靶DNA检测区域降低至15kb以内,精确目标序列。
同时,定制化生产的FISH探针能够有效避免重复序列的背景影响,具有特异性强、更易与靶基因结合、荧光更强、更稳定的特点。
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3. 液相捕获探针
NGS捕获探针是可与基因组目标区域互补的寡核苷酸序列,将经过捕获的探针进行富集后,结合高通量测序技术,可以用来发现和分析SNP位点,以发现复杂疾病的相关基因及位点。
Syno® Array液相捕获探针平台融合了Syno® 3.0 DNA合成平台的高通量、可定制性以及寡核苷酸杂交溶液型序列捕获技术对目标基因组区域的高特异性和高测序读深。除了可以有效捕获SNP、已知及未知突变如Indels、Inversion、Recombination等,也可以万倍以上测序读深捕获许多临床肿瘤相关的基因组区域。
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4. 基因/基因组合成
随着合成生物学的发展,生命科学领域需要构建新的生物元件、分析复杂通路及重新设计现有的自然生物系统。利用高通量DNA合成技术,可以较低的成本,一次性大量合成小片段DNA序列(Oligo Pool) ,再通过Gibson Assembly、酵母体内组装等方法合成超长片段或基因组序列。
泓迅科技拥有Syno® 3.0高通量基因合成平台,可以高通量合成短基因片段,同时拥有Syno® Assembly平台,可高效、稳定地完成20 kb以上的长片段的组装。
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本活动最终解释权归苏州泓迅生物科技股份有限公司所有。

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