shRNA(short hairpin RNA)是一段具有紧密发卡环的RNA序列,包括两个短的反向重复序列和连接两个重复序列的Loop区,是一种将小干扰RNA(siRNA)输送到活体中的形式。siRNA序列可以作为“短发夹”结构克隆进质粒载体中,质粒进入细胞后,该发夹序列表达出来形成双链RNA(dsRNA),并进入RNA干扰(RNAi)通路,最终实现基因沉默的效果。

shRNA文库应用方向

shRNA文库应用非常广泛,主要应用在基因功能研究和基因治疗等方面:

  1. 基因功能研究:利用shRNA文库进行高通量筛选,阐明信号转导通路、发现新的药物作用靶点[1-3]
  2. 基因治疗:使用肿瘤特异性启动子如hTERT启动子、survivin启动子或组织特异性启动子如酪氨酸酶启动子、骨钙素启动子引导针对某些癌基因或抗凋亡分子的siRNA或shRNA表达,从而达到特异性杀伤肿瘤细胞的目的[4]
  3. 治疗病毒性疾病: siRNA可以介导人类细胞的细胞间抗病毒免疫,病毒感染能被针对病毒基因和相关宿主基因的siRNA所阻断[5]

shRNA文库服务优势

  1. 可定制化对shRNA文库载体进行改造,实现可诱导型shRNA文库或带有特殊筛选标记的shRNA文库;
  2. shRNA文库特性较稳定,不易降解;
  3. Syno® 3.0高通量合成shRNA文库,可缩短合成周期,降低合成成本。

shRNA文库泓迅案例
使用Syno® 3.0芯片合成的方法,可以高通量、低价格的合成shRNA序列,可定制化的构建shRNA文库载体,并可进行慢病毒包装服务。经过NGS验证后,最终检测shRNA文库正确率在70%以上。
shRNA library

shRNA文库构建流程图

服务详情

服务名称 产品/服务内容 交付周期 交付项目 价格
shRNA文库构建 合成shRNA芯片并构建文库 40-50个工作日 液态库质粒50-200ug,甘油菌一管 咨询

参考文献

[1] A comparison of multiple shRNA expression methods for combinatorial RNAi. Genet Vaccines Ther. 2011 Apr 17

[2] shRNA library screening identifies nucleocytoplasmic transport as a mediator of BCR-ABL1 kinase-independent resistance. Blood. 2015 Mar 12

[3] shRNA screening identifies JMJD1C as being required for leukemia maintenance. Blood. 2014 Mar 20

[4] Construction of a novel vector expressing the fusion suicide gene yCDglyTK and hTERT-shRNA and its antitumor effects. Exp Ther Med. 2012 Sep;4(3):

[5]Qiu Y, Xu Y, Zhou X.Human virus-derived small RNAs can confer antiviral immunity in mammals. Immunity. 2017 Jun 20;46(6):992-1004

shRNA文库构建服务订购与咨询

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