原核转录组测序

原核转录组测序是基于Illumina测序平台，构建链特异性文库，研究原核生物在某个时期或者在某种环境条件下转录出来的所有mRNA，从而找出关键功能基因。由于原核生物mRNA没有polyA尾结构，需要采用去除rRNA的方法构建文库。

技术路线

分析内容

    1.     原始数据整理、过滤及质量评估
    2.     参考基因组注释信息整理
    3.     比对到参考基因组及结果评估
    4.     eggNOG分类分析
    5.     基因表达量统计
    6.     表达差异基因分析
    7.     表达差异基因GO富集分析
    8.     表达差异基因KEGG富集分析

    9.     表达差异基因聚类分析
    10.     PCA分析
    11.     组间共有差异基因可视化
    12.     cSNP分析
    13.     新转录位点预测
    14.     操纵子预测分析
    15.     UTR分析
    16.     antisense RNA分析

部分分析结果展示
RPKM密度分布&样品相关性检验