原核转录组测序是基于Illumina测序平台，构建链特异性文库，研究原核生物在某个时期或者在某种环境条件下转录出来的所有mRNA，从而找出关键功能基因。由于原核生物mRNA没有polyA尾结构，需要采用去除rRNA的方法构建文库。
技术路线
分析内容
2. 参考序列比对分析 2.1 比对结果统计 2.2 比对结果可视化 2.3 基因组区域分布 2.4 转录组整体质量评估 3. 新转录本预测 4. 基因表达量分析 4.1 不同样品表达量对比 4.2 样本相关性分析 |
5. 基因表达差异分析 5.1 差异表达分析 5.2 组间差异基因venn/花瓣图 5.3 差异基因表达M-A 图 5.4 差异基因表达火山图 5.5 差异基因聚类热图 6. 差异基因GO 和KEGG 富集分析 6.1 差异表达基因GO 富集分析 6.2 差异表达基因KEGG 富集分析 |
部分分析结果展示
案例解析
人类肠道共生菌调节自身免疫
本研究通过转录组测序技术，分别在体外和小鼠模型中研究了Roseburia hominis和宿主细胞的信号转导机制，结果表明Roseburia hominis和宿主细胞之间存在特殊的双向基因表达模型，可用于控制和治疗肠道炎症。
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