宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,是以特定环境样品中整个微生物群落基因组作为研究对象,无需分离培养,直接提取环境样本的DNA进行高通量测序,对环境中微生物的群落结构、菌群多样性、物种分类、功能活性、相互间的协作关系以及与环境之间的关系等宏观特性进行研究,分析环境微生物群体基因组成及功能,解读微生物群体的多样性与丰度,探求微生物与环境、微生物与宿主之间的关系,可以更准确地反应出微生物的真实生存状态。

宏基因组测序不依赖于微生物的分离培养,克服了传统的纯培养方法的技术限制,扩展了微生物资源的利用空间,为微生物研究提供了有效工具。目前,已广泛应用于环境和微生物研究领域。

泓迅科技的宏基因组测序服务可以针对土壤、空气、水体、淤泥、肠道菌群等任何来源提取的全基因组DNA进行检测,除了已纯化的基因组DNA,也可以提供土壤、粪便、液体和组织等样品。

服务优势

  • 通量高、周期短
  • 高通量覆盖可全面检测生态环境中的微生物信息,单次测序针对样本中所有物种,充分挖掘环境样品中的微生物菌群和功能基因,最短可在20个工作日交付检测报告。

  • 效率高、速度快
  • 宏基因组测序采用先进的HiSeq 4000测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据,读长更长。

  • 精度高、信息全
  • 可检测单个碱基差异,准确性高,质量可靠;对于高低丰度的物种基因都能够发现。

  • 经验丰富、专业性强
  • 提供多套引物及科学的实验方案设计,能检测真核生物DNA含量较高的样品,解决各类检测需求;提供全面的抗生素因子分析,可根据客户需求提供定制化分析服务。

    技术路线

    宏基因组测序

    服务详情

    服务项目 样品类型 测序平台 送样要求
    宏基因组测序 宏基因组样品 HiSeq 4000, PE150 环境样本:土壤:5-10g;粪便:3-5g ;沉积物:5-10g;液体:25mL。
    水体:选0.22μm或0.45μm的滤膜,过滤,水样体积5-10mL,最适滤膜面积3-4cm。DNA:总量 ≥ 1 μg、浓度 ≥ 10 ng/μL、1.8 < OD260/280 < 2.0

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