16S rDNA是细菌染色体上编码16S rRNA相对应的DNA序列,存在于所有细菌染色体基因中。16S rDNA由于大小适中(约1.5Kb左右),既能体现不同菌属之间的差异,又能利用测序技术较容易地得到其序列,故被细菌学家和分类学家接受。通过16S rDNA测序可获得提供环境样本物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化、群落比较等诸多信息。

16s rDNA V3-V4区测序是利用高通量测序技术,检测环境样本16S目标区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。该技术可一次性完成多个样本的平行测序,适用于绝大多数细菌的鉴定。

服务优势:

  • 精准鉴定:菌群多样性精确到“种”,无偏差覆盖低丰度物种
  • 先进的分析及算法:最新版Greengene数据库与自建数据库相结合,提供精准的微生物样品组间差异、菌落组成及群落进化等分析
  • 高效率低成本:相比传统菌落鉴定方法,通量提高,成本降低
  • 技术路线:

    16s-rDNA sequence

    服务详情:

    样本类型 测序模式 送样要求 服务周期
    菌体或DNA

    建议DNA总量> 20 ng (无宿主及其他杂质污染)

    MiSeq, PE250/300

    >0.04M clean data

    DNA无明显降解,无蛋白污染,OD260/280值≥1.5,OD260/230值≥1.0,浓度≥30 ng/μL。

    DNA样品:可溶于Nuclease Free 超纯水中,置于1.5 mL管中,封口膜封好,冷冻运输。

    标准流程的服务周期约为60个工作日

    具体项目请咨询

    分析项目:

    16s-rDNA sequence1

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