Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库(Human Genome CRISPR Knockout Libraries)

CRISPR技术作为继ZFN和TALEN之后第三代基因编辑技术,具有高效、快速、精准等特点,广泛应用于基因功能研究、药物开发、作物育种、分子诊断、精准医疗等领域。利用CRISPR 文库进行基因组功能筛选一直是当下热门的研究手段,被全球知名期刊争相报道。

CRISPR文库虽然是进行科学研究的强大工具,但是由于其后期筛选工作量大、成本消耗高,也成为了其普遍应用的阻碍。泓迅科技专注于CRISPR基因编辑技术的研究工作,不断提升服务和产品的供应能力,在定制化CRISPR文库构建的基础上,推出Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库,领先的设计和规范化的文库构建实现高质量交付,降低客户的研究成本,缩短产品交付周期。

Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库根据Genome CRISPR数据库中记录的以前发表的CRISPR筛选中的表型以高靶向活性和低脱靶效率为准则,结合多种不同的设计原则,选择评分较高的sgRNA序列。根据近期发表的评分规则,Syno® CRISPR文库的评分要优于GeCKOv2文库和随机挑选的已发表sgRNA样本。

Syno® 人类全基因组CRISPR敲除文库由三个独立子库A、B、C组成,A、B文库每个基因包含4个sgRNA序列,分别针对18,913和18,334个蛋白质编码基因。子库A包含根据设计标准排名最好的sgRNA,在较低的文库覆盖率下实现高质量的筛选。子库B包含第二层sgRNA,当需要更高的sgRNA覆盖率时,可以用来补充子库A。子库C是通过整合大规模CRISPR筛选的标准化资源,以及多个效率指标,对广泛采用的CRISPR文库中的300,000多个特有的sgRNA进行评估和排序,设计出了一个优化的人类最小全基因组敲除文库,针对18,761个基因,每个基因设计2个优化的sgRNA,合计有37,522个基因靶向和200个非靶向sgRNA。子库C的大小比目前公开的人类全基因组CRISPR文库均小。虽然子库C较小但是并不影响对必须基因的识别,多用于复杂条件下癌症细胞模型的CRISPR筛选。

文库产品优势

  1. 精准的sgRNA设计:利用有效的sgRNA设计模型结合深度学习算法,设计出具有高靶向活性和低脱靶率的sgRNA序列。
    sgRNA library design
  2. 优化的载体:采用lentiCRISPRv2载体,具备Puro药筛功能,可进行慢病毒包装,提高转染效率。
    virus-vector
  3. 节约成本:高编辑效率CRISPR文库,减轻后期筛选工作的难度,降低研究成本。
    sgRNA library synthesis
  4. 一站式服务:提供NGS验证、病毒包装、生信分析等定制化的服务。
    CRISPR-one-stop-service
  5. 严格质控:构建的文库覆盖率>99.9%,均一性<10。
  6. 交付周期短:质粒文库次日发货。

文库产品详情

产品编号 产品名称 序列信息 载体信息 价格(元) 规格
STCRI211101 Syno®人类全基因组CRISPR敲除文库(Human Genome CRISPR Knockout Libraries) 子库A:
靶向18,913个蛋白质编码基因,每个基因设计4个sgRNA序列,合计74,987个sgRNA序列。
lentiCRISPR v2
(带Puro筛选标记)
¥10,000 100μg
STCRI211102 子库B:
靶向18,334个蛋白质编码基因,每个基因设计4个sgRNA序列,合计71,048个sgRNA序列。
lentiCRISPR v2
(带Puro筛选标记)
¥10,000 100μg
STCRI211103 子库C:
靶向18,761个基因,每个基因设计2个sgRNA序列,合计37,522个sgRNA序列和200个对照(非靶向)sgRNA序列。
lentiCRISPR v2
(带Puro筛选标记)
¥10,000 100μg

*更多服务信息,请咨询support@synbio-tech.com

相关服务

sgRNA定制化设计
sgRNA文库构建
ssDNA合成
微生物基因组编辑
哺乳动物基因组编辑
sgRNA生物信息分析

参考资料
[1] Luisa Henkel, Benedikt Rauscher, Barbara Schmitt, et al. Genome-scale CRISPR screening at high sensitivity with an empirically designed sgRNA library. BMC Biol. 2020; 18: 174.
[2]Emanuel Gonçalves, Mark Thomas, Fiona M. Behan, et al. Minimal genome-wide human CRISPR-Cas9 library. Genome Biol. 2021; 22: 40.